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いくら、Pythonに充実した標準ライブラリが備わっているといえども、統計処理をしようと思うと、なかなかすぐにできるものではありません。順位和検定をしたいと思い、Pythonのライブラリを少し探したけど、見つからないのでR（http://www.r-project.org/）との連携を模索したらすぐにいいのが見つかりました。
RPy（http://rpy.sourceforge.net/） 現時点で、RC1が発表されていました。2.4系に対応しています。ちなみに試した環境は、2.4.3 RPyは、rpy-1.0-RC1.win32-py2.4.exeを選択。 インストールは、言われるがままに、 Python for Windows extensions（pywin32-210.win32-py2.4.exe） Numerical Python（Numeric-24.2.win32-py2.4.exe ） をそれぞれ、インストール。R.dllのある場所を、windowsの環境変数PATHに追加。これで、OK！と思いきや、実行すると >>> import rpy RHOME= C:\Program Files\R\R-2.3.1 RVERSION= 2.3.1 RVER= 2031 RUSER= C:\Documents and Settings\tsuji Loading the R DLL C:\Program Files\R\R-2.3.1\bin\R.dll .. Done. Loading Rpy version 2031 .. Traceback (most recent call last): File " import rpy File "C:\Python24\Lib\site-packages\rpy.py", line 112, in -toplevel- exec("import _rpy%s as _rpy" % RVER) File " ImportError: No module named _rpy2031 といったようなメッセージが出る。ここでは、エラーを再現するためにわざとやっているけど、結局、rpyがインストールされたフォルダ（たとえば、C:\Python24\Lib\site-packages）にモジュール（_rpy2031.pyd）がないとダメみたい。今回使ったRC1は、デフォルトでR2.3.1に対応しているので、Rのバージョンをこれにあわせておくと、楽かも。 import rpy wc_result = rpy.r.wilcox_test( data1 , data2, paired = rpy.r.TRUE ); wc_result.get( "p.value" ) で、計算結果のP値を得られる。TRUE,FALSEは、そのまま文字列では書けないので注意。 スポンサーサイト
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